鹽水區位於東經120度28分,北緯23度21分(以區治所在為基準),北與嘉義縣義竹鄉為界,四周分別與後壁區、新營區、下營區、學甲區毗鄰。
全區面積52.2455平方公里,位於八掌溪與急水溪之沖積平原上,全境無山脈、丘陵,為單純之平原。