本府政風處依據「政風機構人員設置管理條例」第六條「各機關政風機構比照各該機關人事機構，設置政風處或政風室。」之規定，於八十一年九月十六日成立；且因應本府於民國99年12月25日臺南縣、市合併為直轄市，本處亦由原臺南縣市政府政風處合併。本處之設立目的係政府為端正政風，促進廉能政治，維護機關安全，及順應民眾對端正行政風氣，防制貪瀆舞弊，建立廉能政府之殷望。
本處職掌依據「政風機構人員設置管理條例」第四條規定及公職人員財產申報法掌理事項如下：
廉政之宣導及社會參與。 廉政法令、預防措施之擬訂、推動及執行。 廉政興革建議之擬訂、協調及推動。 公職人員財產申報、利益衝突迴避及廉政倫理相關業務。 機關有關之貪瀆與不法事項之處理。 對於具有貪瀆風險業務之清查。 機關公務機密維護之處理及協調。 機關安全維護之處理及協調。 其他有關政風事項。