因應新冠肺炎疫情升溫，國內出現感染源不明的本土病例，中央流行疫情指揮中心5月11日下午宣布即日起至6月8日，將疫情警戒提升至第二級。市長黃偉哲表示，臺灣是一日生活圈，目前雖然疫情集中在北部，但臺南千萬不能有僥倖心理，市府將全力配合中央要求，戶外500人以上集會、室內100人以上活動，若不能做到防疫規定，將要求暫停辦理。對於刻意破壞防疫規定者，不聽勸導就開罰。
黃偉哲指出，疫情再起對於全國民眾，不管是在經濟活動、體育活動，或是各類型活動都帶來很大影響，但我們不得不打起精神，即便面對可能的衝擊和不便，還是要共同遵守防疫的規定。市府自己舉辦的活動，包括即將到來的端午節龍舟賽…等，也會依防疫規定辦理。至於民間活動，像西港香…等，雖是民間舉辦，但市府還是會要求嚴格遵守防疫規定；另外像夜市，也要求所有人戴好口罩；餐飲或大賣場等試吃活動絕對禁止；有些餐廳要營業一定要有隔板，各方面要落實，不會寬貸。不能發生因僥倖或漫不經心，而造成防疫的缺口。
臺南市政府表示，配合中央流行疫情指揮中心，將配合防疫升級，請市民朋友務必配合事項如下：
1.避免出入人多擁擠的場所，高感染傳播風險場域，民眾須依規定全程佩戴口罩，未遵守規定且勸導不聽者將嚴格開罰。
2.所有集會活動需落實確保民眾維持社交距離或全程佩戴口罩/使用隔板，並落實「實聯制」、體溫量測、消毒、人流管制、總量管制、動線規劃等措施，否則應暫緩辦理。
3.原則上停辦室外 500 人以上，室內 100 人以上之集會活動，但上述集會活動若能採固定座位且為梅花座、實聯制、全程佩戴口罩、禁止飲食，得提報防疫計畫報請地方主管機構核准後實施。
4.營業場所及公共場域應確保民眾維持社交距離或全程佩戴口罩/使用隔板，並建立實聯制，執行體溫量測、手部消毒、環境清消、人流管制、總量管制、動線規劃等防疫措施；無法落實前述措施之場所應暫停營業。必要時，將強制關閉休閒娛樂相關之營業場所及公共場域。
5.餐飲業應落實「用餐實聯制」、環境定期清潔/消毒，從業人員佩戴口罩、勤洗手，並協助顧客量測體溫、手部消毒、公筷母匙等個人防護措施；非特定對象併桌共餐時，需維持適當區隔/使用隔板；無法落實前述措施之業者，建議民眾外帶用餐。
6.雙鐵（臺鐵、高鐵）、客運等大眾運輸禁止飲食；5月15日起，雙鐵城際列車禁站票。
資料來源：摘錄110.5.11臺南市政府網站/市府新聞