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自106年7月3日起新營、鹽水、柳營等3區戶政事務所，整併為臺南市新營戶政事務所，並分設辦公處。主任1人，課長2人，課員12人，戶籍員11人，辦事員1人，書記1人，計28人。
依據臺南市各戶政事務所組織規程第 5 條規定，本所掌理戶籍及相關登記、戶口校正、戶籍巡迴查對、更改姓名等事項、道路命名與門牌、印鑑管理、日據時代戶口調查簿除戶資料管理、戶口名簿及國民身分證管理、學齡兒童造冊、名冊編造、選舉造冊及戶籍通報等事項、國籍行政、戶籍統計、戶政資訊、行政資訊、文書收發、印信、事務、出納、研考、檔案管理等事項。